Mi-temps thérapeutique : comment le lire sur la fiche de paie ?
Pendant un temps partiel thérapeutique, votre revenu vient de deux sources : votre employeur paie les heures travaillées, l’Assurance maladie compense une partie de la perte. Voici comment s’y retrouver sur le bulletin.
Mis à jour le 9 novembre 2026
Le principe
Le temps partiel pour motif thérapeutique permet de reprendre le travail progressivement, sur prescription de votre médecin traitant, après avis du médecin du travail et accord de principe de l’employeur. Il n’a pas forcément à suivre un arrêt de travail. Les heures et la rémunération se fixent avec l’employeur. Démarches sur service-public.gouv.fr. Cette page concerne les salariés du privé ; pour les fonctionnaires, voir service-public.gouv.fr.
Le salaire : seulement les heures travaillées
| Élément | Base | Montant |
|---|---|---|
| Salaire de base | 151,67 h | 2 400,00 |
| Absence temps partiel thérapeutique 1 | 75,83 h | −1 200,00 |
| Salaire brut 2 | 1 200,00 |
- Les heures non travaillées sont retirées. Le taux horaire, lui, ne change pas.
- Les cotisations se calculent sur ce brut réduit. Les IJSS sont versées à part par la CPAM.
Les indemnités journalières
L’Assurance maladie peut verser des indemnités journalières (IJSS), après avis de son médecin conseil. Elles ne peuvent pas dépasser la perte de salaire due à la réduction du temps de travail : le total ne peut pas dépasser votre salaire à temps plein. La durée de versement dépend de votre situation (affection de longue durée ou non) et de l’avis du médecin conseil : renseignez-vous auprès de votre caisse ou sur ameli.fr.
Exemple : calcul des IJSS
Salaire brut de 2 400 € les 3 mois avant l’arrêt. Les IJSS valent 50 % du salaire journalier de base.
Salaire journalier de base : 2 400 × 3 ÷ 91,25 = 78,90 € IJSS : 78,90 ÷ 2 = 39,45 € par jour Sur 30 jours : 39,45 × 30 = 1 183,50 €
| Reprise à | Salaire | Perte | IJSS versées | Total |
|---|---|---|---|---|
| 50 % | 1 200,00 | 1 200,00 | 1 183,50 | 2 383,50 |
| 60 % | 1 440,00 | 960,00 | 960,00 | 2 400,00 |
| 80 % | 1 920,00 | 480,00 | 480,00 | 2 400,00 |
À 60 % et 80 %, les IJSS sont limitées à la perte de salaire. Montants bruts, calcul simplifié sur un mois de 30 jours ; les IJSS supportent ensuite la CSG et la CRDS.
Sans subrogation
La CPAM vous verse directement les IJSS, en général tous les 14 jours. Elles n’apparaissent pas sur le bulletin.
Avec subrogation
L’employeur les avance et se fait rembourser. Vous voyez une ligne d’IJSS ajoutée au net, ou un maintien de salaire avec déduction des IJSS. Voir les IJSS sur la fiche de paie.
Un complément de l’employeur ?
Le complément légal de l’employeur prévu par l’article L1226-1 du Code du travail vise les absences pour maladie. Pour le temps partiel thérapeutique, c’est surtout votre convention collective, un accord d’entreprise ou votre contrat de prévoyance qui peut prévoir un complément. Lisez-les : certains garantissent un maintien total du salaire.
Les points à vérifier
- Les heures payées correspondent à celles fixées avec l’employeur.
- Avec subrogation : les IJSS ne sont pas déduites deux fois, ni déduites avant d’être reçues sans régularisation ensuite.
- Sans subrogation : vous recevez bien les IJSS de la CPAM (relevé sur votre compte ameli).
- Les primes prévues par votre convention sont versées, au prorata si le texte le prévoit, et non supprimées sans raison.
Congés payés et retraite
Vous êtes en poste et vous travaillez : vous continuez à acquérir vos congés payés comme un salarié à temps partiel, soit 2,5 jours ouvrables par mois, sans réduction. Voir les congés payés sur la fiche de paie.
Pour la retraite, le salaire versé cotise normalement, et les indemnités journalières de maladie peuvent aussi valider des trimestres, selon les règles de l’Assurance retraite.
À retenir
- L’employeur paie les heures travaillées, au même taux horaire.
- Les IJSS compensent la perte, sans jamais la dépasser.
- Sans subrogation, les IJSS n’apparaissent pas sur le bulletin.
- Les congés payés s’acquièrent normalement.
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Questions fréquentes
Comment est payé un mi-temps thérapeutique ?
L’employeur paie les heures travaillées et l’Assurance maladie peut verser des indemnités journalières pour compenser une partie de la perte, sans que le total dépasse votre salaire à temps plein.
Pourquoi ma fiche de paie a une ligne d’absence pendant mon mi-temps thérapeutique ?
Certains logiciels gardent le salaire de base entier et retirent les heures non travaillées par une ligne d’absence. C’est normal si le résultat correspond au temps travaillé.
Est-ce que je perds des congés payés en temps partiel thérapeutique ?
Non. Comme tout salarié à temps partiel, vous acquérez 2,5 jours ouvrables par mois de travail.
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Ce guide donne des informations générales sur le droit du travail français. Il ne remplace pas un conseil juridique : votre convention collective ou votre contrat peuvent prévoir des règles plus favorables. En cas de doute, rapprochez-vous de votre service paie, d’un représentant du personnel, de l’inspection du travail ou d’un professionnel du droit.